O razítko přišla Peková kvůli posudku, který vypracovala pro slovenského vládního zmocněnce Petera Kotlára s názvem: „Kvantitativní stanovení obsahu nukleových kyselin DNA a RNA v šaržích vakcíny Spikevax (Moderna) a šaržích vakcíny BNT162b2 (Pfizer)“
„Jakkoliv je znalec samostatným ekonomickým subjektem, výkonem znalecké činnosti, jenž svým charakterem vykazuje též znaky veřejného úřadu, na sebe bere požadavek nestrannosti jako jednu ze svých hlavních povinností,“ uvedlo ministerstvo k důkazu, že Peková s Kotlárem spolupracovala před vyhotovením posudku a i po něm, a to vedlo k narušení její nestrannosti a nezaujatosti.
Soňa Peková ve svém znaleckém posudku doporučila stáhnout z trhu vakcíny proti covidu-19 značek Pfizer a Moderna. Analýza jednotlivých šarží podle ní totiž ukázala, že přípravky obsahují nadlimitní množství nukleových kyselin, kterými měly být kontaminovány, avšak podle Slovenské akademie věd nebyly vakcíny srovnány s předepsanými a kontrolovanými limity látek.
Proti rozhodnutí ministerstva se může do patnácti dnů od oznámení rozsudku Peková ještě odvolat. „Už se tomu nebráním, neb ve stávající legislativě nevidím pro sebe žádný racionální ani obhajitelný důvod, abych v daném systému setrvávala,“ uvedla ale Peková ve svém vyjádření na Facebooku.